Skip to content
2 miesiące ago

326 words

W 12 dni po zmianie rytmy transkryptu w pełni dostosowały się do nowego cyklu LD (ryc. 2A). Profile transkryptów różnych genów zegarowych w pośrednich punktach czasowych wykazywały znaczne różnice w ich indywidualnych charakterystykach adaptacyjnych. Aby oszacować kinetykę adaptacji ekspresji genów zegarowych, określiliśmy piki mRNA za pomocą regresji fali sinusoidalnej (Figura 2A). Rytmiczność ekspresji okołodobowej zweryfikowano za pomocą oprogramowania CircWave (nr ref. 34 i Tabela uzupełniająca 1, materiał uzupełniający dostępny online w tym artykule; doi: 10.1172 / JCI41192DS1). Wyznaczono punkt czasowy szczytowej ekspresji dla każdego genu i dnia. Aby ułatwić bezpośrednie porównanie resetowania rytmów ekspresji różnych genów zegarowych, czasy szczytowe w dniach 2, 3, 4 i 12 wykreślono w odniesieniu do tych w dniu 0 (Figura 2B). Podobne do naszych początkowych wyników działania (Figura 1B), resetowanie szczytów ekspresji genów zegarowych następowało po kinetyce sigmoidalnej, przy pełnym przestawieniu osiągniętym pomiędzy dniem 3 (Per2) a dniem 8 (Nr1d1). Wartości PS50 ujawniły znaczną różnicę w kinetyce adaptacji pomiędzy różnymi genami zegarowymi (Figura 2C). Zgodnie z poprzednią pracą (22) geny okresu szybko dostosowały się do nowego harmonogramu światła. Co ważne, inne geny zegara wykazywały znacznie wolniejsze tempo adaptacji, w większym stopniu odzwierciedlając obserwowaną aktywność kół jezdnych (rysunek 2C). Ryc. 2Resetowanie genów zegarowych podczas jet lag w SCN. (A) Dobowe profile mRNA (średnia . SEM) z 5 różnych genów zegarowych w dniach 0, 2, 3, 4 i 12 po przesunięciu LD, nałożone pasmami fal sinusoidalnych (czarne). Ciemne fazy są oznaczone szarym cieniem. W każdym punkcie czasowym wykorzystano 3 zwierzęta. (B) Przesunięcia szczytów czasowych ekspresji genów uzyskane z danych ISH w A wykazały, że adaptacja do nowego harmonogramu oświetlenia była zró.nicowana dla 5 genów zegarowych (średnia. SEM). Kolory są takie, jak wskazano w A i C. (C) wartości PS50 (średnia. SEM) genów zegarowych w SCN (z B) i ponownym umiejscowieniu aktywności (z Figury 1B). ** P. 0,01, *** P <0,001 versus Per2. Patrz tabela dodatkowa 2 w celu uzyskania wyników analizy statystycznej. Zegary obwodowe różnią się szybkością regulacji podczas opóźnienia w czasie jazdy. W celu określenia szybkości adaptacji zegarów peryferyjnych u myszy poddanych warunkom jet lag, mierzono ekspresję genów zegarowych za pomocą ilościowej reakcji PCR w czasie rzeczywistym (qPCR, nadnercza, nerka, wątroba i trzustka) lub przez ISH (kora somatosensoryczna) w dni 0, 2, 3, 4, i 8 lub 12 po 6-godzinnym wyprzedzeniu cyklu LD. Regresja fali sinusoidalnej i testowanie F za pomocą oprogramowania CircWave (34) wykazały, że wzorce ekspresji genów były zawsze rytmiczne (Suplementowa Figura i Tabela Uzupełniająca 1). Wartości PS50 określono jak opisano powyżej dla SCN; wartości dla wszystkich badanych tkanek przedstawiono na fig. 3. Kora somatosensoryczna i SCN wykazywały podobny wzór adaptacji genu zegara (porównaj Fig. 2C i Figura 3A). W obu przypadkach zaobserwowaliśmy szybką reakcję Per1 i Per2, a następnie wolniejszą odpowiedź dla Dbp, Arntl i Nr1d1. Szybkość korekty genów okresu nie była tak szybka w tkankach nieneuronalnych, z wyjątkiem nadnerczy. Per2 przesunął się najszybciej w nerkach i wątrobie, podczas gdy Arntl przesunął się najwolniej, a P1 przesunął się wolniej, porównywalnie do Dbp i Nr1d1 (Ryc. 3, B. D). W ostrym kontraście, Per1 i Per2 były powolne do zresetowania w trzustce, podczas gdy Nr1d1 szybko się skorygował (Figura 3E). Warto zauważyć, że wartości PS50 na Figurze 3E zostały potwierdzone przez powtarzaną analizę, co daje wartość P wynoszącą 0,05 lub mniej dla Nr1d1 w porównaniu z Per2. Figura 3: Kinetyka resetowania genów w różnych tkankach po 6-godzinnym przyspieszeniu fazy LD. Resetowanie jest reprezentowane przez wartości PS50 (średnia. SEM) [patrz też: zimbra gratka, jak szybko obniżyć ciśnienie, kminek właściwości ]

0 thoughts on “dobre awokado”